Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms