Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX10Q12887 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX10Q12887 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX10Q12887 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COX10Q12887 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COX10Q12887 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COX10Q12887 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX10Q12887 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX10Q12887 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms