Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCB1Q12824 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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