Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms