Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALD1Q05682 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms