Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms