Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms