Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBE1Q04446 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBE1Q04446 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms