Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRB3Q04118 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms