Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms