Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFNB1P98172 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB1P98172 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms