Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRX1P78414 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms