Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A1P68400 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms