Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLDN15P56746 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN15P56746 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms