Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSWP56202 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTSWP56202 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTSWP56202 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSWP56202 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSWP56202 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSWP56202 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSWP56202 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSWP56202 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSWP56202 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSWP56202 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSWP56202 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSWP56202 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSWP56202 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSWP56202 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms