Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNU13P55769 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNU13P55769 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms