Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP9P55211 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP9P55211 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP9P55211 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP9P55211 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms