Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PGGT1BP53609 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PGGT1BP53609 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PGGT1BP53609 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PGGT1BP53609 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PGGT1BP53609 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGGT1BP53609 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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