Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX2P52951 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX2P52951 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX2P52951 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 960.5 ms