Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF6P49848 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF6P49848 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF6P49848 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF6P49848 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF6P49848 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF6P49848 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms