Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GSK3BP49841 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GSK3BP49841 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms