Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms