Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATP5C1P36542 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms