Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN4AP35499 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN4AP35499 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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