Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPC1P35052 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPC1P35052 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPC1P35052 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms