Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA7P31268 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms