Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
S100A1P23297 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
S100A1P23297 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
S100A1P23297 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
S100A1P23297 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
S100A1P23297 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms