Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKACBP22694 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms