Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDSP20132 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDSP20132 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDSP20132 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDSP20132 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDSP20132 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDSP20132 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDSP20132 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDSP20132 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDSP20132 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
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