Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LBPP18428 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LBPP18428 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LBPP18428 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LBPP18428 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms