Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms