Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM27P14373 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms