Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF35P13682 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms