Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP1P11387 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms