Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCF2P10911 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCF2P10911 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCF2P10911 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCF2P10911 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCF2P10911 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms