Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms