Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI2P10070 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI2P10070 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI2P10070 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI2P10070 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI2P10070 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI2P10070 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI2P10070 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI2P10070 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms