Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB7P09629 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms