Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDHBP07195 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDHBP07195 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDHBP07195 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDHBP07195 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDHBP07195 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDHBP07195 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms