Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA2P01563 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA2P01563 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms