Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms