Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRMUO75648 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms