Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA4O75335 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms