Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms