Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRC1O43663 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRC1O43663 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRC1O43663 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRC1O43663 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRC1O43663 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRC1O43663 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRC1O43663 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRC1O43663 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRC1O43663 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRC1O43663 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRC1O43663 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRC1O43663 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRC1O43663 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRC1O43663 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms