Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms