Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CLOCKO15516 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms