Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DFFAO00273 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DFFAO00273 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms