Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9PCH4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9PCH4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9PCH4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
E9PCH4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E9PCH4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E9PCH4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms