Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRRM5B3KS81 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms